Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TNNI3P19429 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNI3P19429 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TNNI3P19429 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TNNI3P19429 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms