Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITGB4P16144 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
ITGB4P16144 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGB4P16144 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGB4P16144 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGB4P16144 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITGB4P16144 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ITGB4P16144 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
ITGB4P16144 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGB4P16144 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGB4P16144 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGB4P16144 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGB4P16144 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITGB4P16144 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ITGB4P16144 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ITGB4P16144 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ITGB4P16144 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
ITGB4P16144 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ITGB4P16144 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ITGB4P16144 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGB4P16144 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGB4P16144 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGB4P16144 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITGB4P16144 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ITGB4P16144 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGB4P16144 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms