Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFITM1P13164 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM1P13164 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms