Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNF888P0CJ79 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF888P0CJ79 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms