Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNAP02545 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNAP02545 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNAP02545 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNAP02545 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNAP02545 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNAP02545 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNAP02545 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNAP02545 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNAP02545 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNAP02545 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNAP02545 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNAP02545 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNAP02545 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNAP02545 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNAP02545 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMNAP02545 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMNAP02545 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMNAP02545 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNAP02545 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNAP02545 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNAP02545 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNAP02545 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNAP02545 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNAP02545 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNAP02545 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNAP02545 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNAP02545 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNAP02545 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNAP02545 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNAP02545 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNAP02545 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNAP02545 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNAP02545 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNAP02545 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNAP02545 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNAP02545 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNAP02545 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNAP02545 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNAP02545 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNAP02545 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNAP02545 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNAP02545 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNAP02545 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNAP02545 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNAP02545 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNAP02545 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNAP02545 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMNAP02545 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNAP02545 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNAP02545 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNAP02545 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNAP02545 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNAP02545 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNAP02545 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNAP02545 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNAP02545 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNAP02545 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNAP02545 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNAP02545 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNAP02545 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNAP02545 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNAP02545 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNAP02545 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNAP02545 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMNAP02545 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNAP02545 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNAP02545 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNAP02545 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNAP02545 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNAP02545 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMNAP02545 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNAP02545 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNAP02545 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNAP02545 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNAP02545 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNAP02545 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNAP02545 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNAP02545 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNAP02545 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNAP02545 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNAP02545 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNAP02545 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNAP02545 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNAP02545 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMNAP02545 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNAP02545 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNAP02545 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNAP02545 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNAP02545 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNAP02545 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNAP02545 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNAP02545 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNAP02545 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNAP02545 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMNAP02545 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNAP02545 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNAP02545 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNAP02545 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMNAP02545 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms