Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6orf47O95873 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C6orf47O95873 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms