Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEBLO76041 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEBLO76041 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEBLO76041 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEBLO76041 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEBLO76041 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEBLO76041 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEBLO76041 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEBLO76041 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEBLO76041 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEBLO76041 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEBLO76041 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEBLO76041 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEBLO76041 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEBLO76041 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEBLO76041 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEBLO76041 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEBLO76041 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEBLO76041 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEBLO76041 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEBLO76041 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NEBLO76041 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEBLO76041 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEBLO76041 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEBLO76041 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEBLO76041 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEBLO76041 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEBLO76041 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEBLO76041 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEBLO76041 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEBLO76041 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEBLO76041 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEBLO76041 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEBLO76041 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEBLO76041 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEBLO76041 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEBLO76041 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEBLO76041 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEBLO76041 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEBLO76041 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEBLO76041 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEBLO76041 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEBLO76041 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEBLO76041 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEBLO76041 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEBLO76041 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEBLO76041 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEBLO76041 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEBLO76041 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEBLO76041 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEBLO76041 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEBLO76041 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEBLO76041 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEBLO76041 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEBLO76041 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEBLO76041 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEBLO76041 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEBLO76041 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEBLO76041 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NEBLO76041 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEBLO76041 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEBLO76041 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEBLO76041 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEBLO76041 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEBLO76041 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEBLO76041 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEBLO76041 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEBLO76041 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEBLO76041 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEBLO76041 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEBLO76041 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEBLO76041 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEBLO76041 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEBLO76041 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEBLO76041 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEBLO76041 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEBLO76041 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEBLO76041 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEBLO76041 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEBLO76041 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEBLO76041 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEBLO76041 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEBLO76041 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEBLO76041 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEBLO76041 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEBLO76041 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEBLO76041 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEBLO76041 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEBLO76041 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NEBLO76041 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEBLO76041 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEBLO76041 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEBLO76041 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEBLO76041 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEBLO76041 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEBLO76041 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEBLO76041 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEBLO76041 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEBLO76041 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEBLO76041 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159 ms