Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
N4BP1O75113 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
N4BP1O75113 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
N4BP1O75113 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
N4BP1O75113 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
N4BP1O75113 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
N4BP1O75113 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
N4BP1O75113 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
N4BP1O75113 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
N4BP1O75113 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
N4BP1O75113 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
N4BP1O75113 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
N4BP1O75113 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
N4BP1O75113 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
N4BP1O75113 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
N4BP1O75113 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
N4BP1O75113 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
N4BP1O75113 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
N4BP1O75113 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
N4BP1O75113 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
N4BP1O75113 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
N4BP1O75113 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
N4BP1O75113 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
N4BP1O75113 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
N4BP1O75113 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
N4BP1O75113 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
N4BP1O75113 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
N4BP1O75113 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
N4BP1O75113 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
N4BP1O75113 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
N4BP1O75113 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
N4BP1O75113 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
N4BP1O75113 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
N4BP1O75113 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
N4BP1O75113 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
N4BP1O75113 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
N4BP1O75113 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
N4BP1O75113 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
N4BP1O75113 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
N4BP1O75113 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
N4BP1O75113 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
N4BP1O75113 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
N4BP1O75113 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
N4BP1O75113 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
N4BP1O75113 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
N4BP1O75113 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
N4BP1O75113 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
N4BP1O75113 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
N4BP1O75113 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
N4BP1O75113 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms