Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKNO60260 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKNO60260 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKNO60260 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKNO60260 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKNO60260 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKNO60260 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKNO60260 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKNO60260 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKNO60260 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKNO60260 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKNO60260 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKNO60260 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKNO60260 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKNO60260 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKNO60260 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRKNO60260 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKNO60260 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKNO60260 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKNO60260 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKNO60260 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKNO60260 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKNO60260 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKNO60260 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKNO60260 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKNO60260 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRKNO60260 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKNO60260 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKNO60260 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKNO60260 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKNO60260 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKNO60260 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKNO60260 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKNO60260 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKNO60260 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKNO60260 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKNO60260 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKNO60260 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKNO60260 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKNO60260 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKNO60260 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKNO60260 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKNO60260 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKNO60260 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKNO60260 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKNO60260 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKNO60260 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKNO60260 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKNO60260 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKNO60260 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKNO60260 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKNO60260 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKNO60260 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKNO60260 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKNO60260 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKNO60260 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKNO60260 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKNO60260 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKNO60260 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKNO60260 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKNO60260 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKNO60260 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKNO60260 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKNO60260 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKNO60260 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKNO60260 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKNO60260 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKNO60260 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKNO60260 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKNO60260 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKNO60260 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKNO60260 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKNO60260 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKNO60260 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKNO60260 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKNO60260 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKNO60260 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKNO60260 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKNO60260 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKNO60260 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKNO60260 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKNO60260 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKNO60260 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKNO60260 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKNO60260 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKNO60260 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKNO60260 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKNO60260 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKNO60260 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKNO60260 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKNO60260 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKNO60260 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKNO60260 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKNO60260 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKNO60260 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKNO60260 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKNO60260 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKNO60260 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKNO60260 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKNO60260 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms