Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMPRSS11DO60235 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMPRSS11DO60235 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPRSS11DO60235 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms