Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP1O00294 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP1O00294 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP1O00294 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP1O00294 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP1O00294 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP1O00294 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP1O00294 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP1O00294 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP1O00294 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP1O00294 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TULP1O00294 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TULP1O00294 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TULP1O00294 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TULP1O00294 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TULP1O00294 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TULP1O00294 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TULP1O00294 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TULP1O00294 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TULP1O00294 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TULP1O00294 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TULP1O00294 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TULP1O00294 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TULP1O00294 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TULP1O00294 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TULP1O00294 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TULP1O00294 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TULP1O00294 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TULP1O00294 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TULP1O00294 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TULP1O00294 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TULP1O00294 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TULP1O00294 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TULP1O00294 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TULP1O00294 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TULP1O00294 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TULP1O00294 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TULP1O00294 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TULP1O00294 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TULP1O00294 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TULP1O00294 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TULP1O00294 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TULP1O00294 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TULP1O00294 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TULP1O00294 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TULP1O00294 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TULP1O00294 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TULP1O00294 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TULP1O00294 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TULP1O00294 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TULP1O00294 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TULP1O00294 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TULP1O00294 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP1O00294 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP1O00294 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP1O00294 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP1O00294 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP1O00294 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP1O00294 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP1O00294 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP1O00294 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP1O00294 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP1O00294 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP1O00294 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TULP1O00294 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TULP1O00294 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TULP1O00294 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TULP1O00294 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TULP1O00294 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TULP1O00294 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP1O00294 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP1O00294 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TULP1O00294 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP1O00294 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP1O00294 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TULP1O00294 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TULP1O00294 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TULP1O00294 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TULP1O00294 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TULP1O00294 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TULP1O00294 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TULP1O00294 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TULP1O00294 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TULP1O00294 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TULP1O00294 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TULP1O00294 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TULP1O00294 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TULP1O00294 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TULP1O00294 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TULP1O00294 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TULP1O00294 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP1O00294 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP1O00294 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP1O00294 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP1O00294 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP1O00294 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP1O00294 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TULP1O00294 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP1O00294 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TULP1O00294 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms