Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF103O00237 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF103O00237 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF103O00237 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF103O00237 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF103O00237 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF103O00237 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF103O00237 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF103O00237 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF103O00237 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF103O00237 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF103O00237 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF103O00237 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF103O00237 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF103O00237 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF103O00237 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF103O00237 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF103O00237 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF103O00237 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF103O00237 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF103O00237 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF103O00237 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF103O00237 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF103O00237 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF103O00237 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF103O00237 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF103O00237 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF103O00237 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF103O00237 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF103O00237 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF103O00237 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF103O00237 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF103O00237 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF103O00237 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF103O00237 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF103O00237 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF103O00237 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF103O00237 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF103O00237 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF103O00237 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF103O00237 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF103O00237 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF103O00237 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF103O00237 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF103O00237 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF103O00237 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF103O00237 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF103O00237 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF103O00237 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF103O00237 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF103O00237 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF103O00237 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF103O00237 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF103O00237 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF103O00237 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF103O00237 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF103O00237 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF103O00237 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF103O00237 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF103O00237 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF103O00237 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF103O00237 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF103O00237 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF103O00237 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF103O00237 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF103O00237 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF103O00237 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF103O00237 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF103O00237 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF103O00237 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF103O00237 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF103O00237 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF103O00237 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF103O00237 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF103O00237 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF103O00237 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF103O00237 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF103O00237 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF103O00237 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF103O00237 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF103O00237 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF103O00237 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF103O00237 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF103O00237 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF103O00237 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF103O00237 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF103O00237 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF103O00237 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF103O00237 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF103O00237 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF103O00237 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF103O00237 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF103O00237 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF103O00237 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF103O00237 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF103O00237 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF103O00237 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF103O00237 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF103O00237 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF103O00237 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms