Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
E9PCH4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
E9PCH4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
E9PCH4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
E9PCH4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
E9PCH4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
E9PCH4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
E9PCH4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
E9PCH4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
E9PCH4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
E9PCH4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
E9PCH4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
E9PCH4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
E9PCH4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
E9PCH4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
E9PCH4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
E9PCH4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
E9PCH4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
E9PCH4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
E9PCH4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
E9PCH4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
E9PCH4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
E9PCH4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
E9PCH4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
E9PCH4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
E9PCH4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
E9PCH4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
E9PCH4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
E9PCH4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
E9PCH4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
E9PCH4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
E9PCH4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
E9PCH4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
E9PCH4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
E9PCH4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.11
E9PCH4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
E9PCH4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
E9PCH4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
E9PCH4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
E9PCH4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
E9PCH4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
E9PCH4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
E9PCH4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
E9PCH4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
E9PCH4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
E9PCH4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
E9PCH4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
E9PCH4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
E9PCH4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
E9PCH4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
E9PCH4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
E9PCH4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
E9PCH4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
E9PCH4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
E9PCH4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
E9PCH4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
E9PCH4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
E9PCH4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
E9PCH4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
E9PCH4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
E9PCH4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
E9PCH4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
E9PCH4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
E9PCH4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
E9PCH4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
E9PCH4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
E9PCH4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
E9PCH4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
E9PCH4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
E9PCH4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
E9PCH4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
E9PCH4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
E9PCH4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
E9PCH4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
E9PCH4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
E9PCH4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
E9PCH4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
E9PCH4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
E9PCH4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
E9PCH4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
E9PCH4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
E9PCH4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
E9PCH4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
E9PCH4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
E9PCH4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
E9PCH4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
E9PCH4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
E9PCH4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
E9PCH4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
E9PCH4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
E9PCH4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
E9PCH4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
E9PCH4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
E9PCH4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
E9PCH4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
E9PCH4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
E9PCH4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
E9PCH4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
E9PCH4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
E9PCH4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 279 ms