Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCRIP1C9JLW8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCRIP1C9JLW8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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