Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GGTLC3B5MD39 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GGTLC3B5MD39 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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