Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CYSRT1A8MQ03 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYSRT1A8MQ03 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYSRT1A8MQ03 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms