Protein–RNA interactions for Protein: A6NJ88

SAGE2P, Putative SAGE1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAGE2PA6NJ88 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAGE2PA6NJ88 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAGE2PA6NJ88 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAGE2PA6NJ88 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAGE2PA6NJ88 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAGE2PA6NJ88 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAGE2PA6NJ88 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAGE2PA6NJ88 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAGE2PA6NJ88 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SAGE2PA6NJ88 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAGE2PA6NJ88 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAGE2PA6NJ88 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAGE2PA6NJ88 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAGE2PA6NJ88 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAGE2PA6NJ88 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAGE2PA6NJ88 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAGE2PA6NJ88 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAGE2PA6NJ88 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SAGE2PA6NJ88 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SAGE2PA6NJ88 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SAGE2PA6NJ88 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAGE2PA6NJ88 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAGE2PA6NJ88 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms