Protein–RNA interactions for Protein: A4QN01

LINC01553, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01553, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01553A4QN01 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LINC01553A4QN01 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LINC01553A4QN01 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LINC01553A4QN01 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms