Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.753e-6■■■■■ 88.3
AARSP49588 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.413e-6■■■■■ 88.3
AARSP49588 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.43e-6■■■■■ 88.3
AARSP49588 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 88.3
AARSP49588 CHID1-224ENST00000534254 1019 ntTSL 514.71□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 88.3
AARSP49588 CHID1-219ENST00000531859 834 ntTSL 514.1□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 88.3
AARSP49588 CHID1-205ENST00000454838 3255 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 88.3
AARSP49588 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.353e-6■■■■■ 88.3
AARSP49588 CHID1-207ENST00000524832 878 ntTSL 211.61□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 88.3
AARSP49588 CHID1-210ENST00000526714 976 ntTSL 511.42□□□□□ -0.583e-6■■■■■ 88.3
AARSP49588 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.011e-9■■■■■ 87.3
AARSP49588 CHMP1A-204ENST00000547687 2007 ntTSL 1 (best)17.6■□□□□ 0.411e-9■■■■■ 87.3
AARSP49588 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.051e-9■■■■■ 87.3
AARSP49588 VCL-205ENST00000478896 727 ntTSL 514.38□□□□□ -0.116e-7■■■■■ 85.6
AARSP49588 VCL-202ENST00000372755 6489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.446e-7■■■■■ 85.6
AARSP49588 VCL-201ENST00000211998 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.646e-7■■■■■ 85.6
AARSP49588 VCL-207ENST00000624354 3307 ntTSL 29.71□□□□□ -0.866e-7■■■■■ 85.6
AARSP49588 VCL-206ENST00000623461 7995 ntTSL 1 (best)9.49□□□□□ -0.896e-7■■■■■ 85.6
AARSP49588 RNF220-201ENST00000335497 1203 ntTSL 528.28■■■□□ 2.123e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.943e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 RNF220-208ENST00000471494 720 ntTSL 525.39■■□□□ 1.663e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.483e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 COL18A1-207ENST00000473212 2515 ntTSL 223.55■■□□□ 1.363e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.313e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.313e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 RNF220-209ENST00000474064 2734 ntTSL 223.22■■□□□ 1.313e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 GAS6-202ENST00000476291 537 ntTSL 223.01■■□□□ 1.273e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.243e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.173e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 PTPRF-207ENST00000436724 2168 ntTSL 1 (best)22.2■■□□□ 1.143e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.063e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 MOK-219ENST00000521766 2736 ntTSL 221.63■■□□□ 1.053e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.043e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.993e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 RNF220-205ENST00000440132 1200 ntTSL 221.03■□□□□ 0.963e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 MOK-210ENST00000519569 2355 ntTSL 220.96■□□□□ 0.953e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.943e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.923e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 ASB13-203ENST00000479033 2565 ntTSL 220.51■□□□□ 0.873e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 MOK-215ENST00000520266 878 ntTSL 320.31■□□□□ 0.843e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 CEP68-203ENST00000475851 550 ntTSL 420.29■□□□□ 0.843e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.83e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 CDKN1A-206ENST00000462537 553 ntTSL 320.03■□□□□ 0.83e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 RNF220-214ENST00000484745 1951 ntTSL 519.88■□□□□ 0.773e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.743e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 CDKN1A-205ENST00000459970 604 ntTSL 519.62■□□□□ 0.733e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 RNF220-212ENST00000475378 916 ntTSL 319.56■□□□□ 0.723e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.73e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 MOK-229ENST00000523485 2705 ntTSL 219.29■□□□□ 0.683e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.633e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.563e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.533e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 SH3BP5L-203ENST00000484202 3110 ntTSL 218.36■□□□□ 0.533e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 CDKN1A-207ENST00000478800 616 ntTSL 218.34■□□□□ 0.533e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 MOK-207ENST00000518686 2897 ntTSL 218.22■□□□□ 0.513e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.513e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 ASB13-202ENST00000459912 2780 ntTSL 1 (best)18.12■□□□□ 0.493e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.493e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.443e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 COL18A1-205ENST00000423214 839 ntTSL 517.53■□□□□ 0.43e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.213e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.173e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.173e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.173e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.143e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 SH3BP5L-202ENST00000475978 4122 ntTSL 215.76■□□□□ 0.113e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.113e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.083e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.083e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 SART3-208ENST00000547528 1935 ntTSL 1 (best)15.39■□□□□ 0.053e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 RNF220-218ENST00000497469 590 ntTSL 215.28■□□□□ 0.043e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 PTPRF-202ENST00000372405 1962 ntTSL 1 (best)14.54□□□□□ -0.083e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.093e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 RNF220-213ENST00000480686 3835 ntTSL 214.18□□□□□ -0.143e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.143e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 AGAP3-223ENST00000492234 560 ntTSL 414.14□□□□□ -0.153e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 MOK-238ENST00000559838 643 ntTSL 314.06□□□□□ -0.163e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 SART3-206ENST00000546815 2318 ntTSL 514.05□□□□□ -0.163e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 AP001347.1-203ENST00000448463 780 ntTSL 214□□□□□ -0.173e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.213e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 DLEU1-218ENST00000475913 534 ntTSL 1 (best)13.61□□□□□ -0.233e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 DLEU1-231ENST00000490577 2440 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.233e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 DLEU1-203ENST00000461527 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.233e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 MOK-236ENST00000559138 2041 ntTSL 1 (best)13.52□□□□□ -0.253e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 SART3-202ENST00000431469 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.313e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 PTPRF-208ENST00000437607 788 ntTSL 1 (best)12.97□□□□□ -0.333e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 XPNPEP1-203ENST00000369683 2344 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.343e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.343e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 XPNPEP1-224ENST00000508275 563 ntTSL 312.76□□□□□ -0.373e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 AC007389.1-202ENST00000377977 1266 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.373e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 DLEU1-208ENST00000468168 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.43e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 DLEU1-232ENST00000491341 1141 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.433e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 XPNPEP1-213ENST00000488118 4384 ntTSL 1 (best)12.2□□□□□ -0.463e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 AC007389.1-201ENST00000606978 1117 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.463e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 BTBD9-201ENST00000314100 8486 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.473e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 ANKFY1-213ENST00000575955 948 ntTSL 212.09□□□□□ -0.473e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 DLEU1-219ENST00000476738 838 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.523e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 BTBD9-202ENST00000328403 1968 ntTSL 211.72□□□□□ -0.533e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 DLEU1-207ENST00000467721 1455 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.543e-8■■■■■ 82.4
AARSP49588 RNF220-210ENST00000474394 810 ntTSL 311.64□□□□□ -0.553e-8■■■■■ 82.4
Retrieved 100 of 8,200 protein–RNA pairs in 3306.3 ms