Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX13Q9Y5W8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
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