Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COL4A3BPQ9Y5P4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COL4A3BPQ9Y5P4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms