Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y543

HES2, Transcription factor HES-2, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES2Q9Y543 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
HES2Q9Y543 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HES2Q9Y543 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HES2Q9Y543 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms