Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NOP58Q9Y2X3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
NOP58Q9Y2X3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NOP58Q9Y2X3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NOP58Q9Y2X3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms