Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2C9

TLR6, Toll-like receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR6Q9Y2C9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLR6Q9Y2C9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR6Q9Y2C9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR6Q9Y2C9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR6Q9Y2C9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR6Q9Y2C9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR6Q9Y2C9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR6Q9Y2C9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR6Q9Y2C9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR6Q9Y2C9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR6Q9Y2C9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR6Q9Y2C9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR6Q9Y2C9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR6Q9Y2C9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR6Q9Y2C9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TLR6Q9Y2C9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TLR6Q9Y2C9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms