Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUDCQ9Y266 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
NUDCQ9Y266 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUDCQ9Y266 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms