Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF6Q9Y252 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF6Q9Y252 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF6Q9Y252 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms