Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
HPS5Q9UPZ3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HPS5Q9UPZ3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HPS5Q9UPZ3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms