Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PNMA2Q9UL42 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNMA2Q9UL42 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PNMA2Q9UL42 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms