Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF346Q9UL40 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF346Q9UL40 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF346Q9UL40 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms