Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY7

CDV3, Protein CDV3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3Q9UKY7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDV3Q9UKY7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDV3Q9UKY7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDV3Q9UKY7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.8 ms