Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACSL6Q9UKU0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ACSL6Q9UKU0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms