Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RPUSD1Q9UJJ7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RPUSD1Q9UJJ7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPUSD1Q9UJJ7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RPUSD1Q9UJJ7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPUSD1Q9UJJ7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPUSD1Q9UJJ7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPUSD1Q9UJJ7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPUSD1Q9UJJ7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPUSD1Q9UJJ7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPUSD1Q9UJJ7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPUSD1Q9UJJ7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPUSD1Q9UJJ7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPUSD1Q9UJJ7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPUSD1Q9UJJ7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RPUSD1Q9UJJ7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPUSD1Q9UJJ7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RPUSD1Q9UJJ7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.6 ms