Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PLXNA1Q9UIW2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PLXNA1Q9UIW2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLXNA1Q9UIW2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms