Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
USP35Q9P2H5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
USP35Q9P2H5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC31.86■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
USP35Q9P2H5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
USP35Q9P2H5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
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