Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD8

SPG21, Maspardin, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG21Q9NZD8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPG21Q9NZD8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPG21Q9NZD8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPG21Q9NZD8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPG21Q9NZD8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPG21Q9NZD8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPG21Q9NZD8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPG21Q9NZD8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPG21Q9NZD8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPG21Q9NZD8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPG21Q9NZD8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPG21Q9NZD8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPG21Q9NZD8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPG21Q9NZD8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPG21Q9NZD8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPG21Q9NZD8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPG21Q9NZD8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPG21Q9NZD8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SPG21Q9NZD8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.7 ms