Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PODXL2Q9NZ53 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PODXL2Q9NZ53 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PODXL2Q9NZ53 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms