Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BATF3Q9NR55 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BATF3Q9NR55 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BATF3Q9NR55 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms