Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA90

EFCC1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCC1Q9HA90 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.57■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.57■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.55■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
EFCC1Q9HA90 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
EFCC1Q9HA90 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EFCC1Q9HA90 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms