Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC113Q9H0I3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC113Q9H0I3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC113Q9H0I3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC113Q9H0I3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.1 ms