Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHACTR1Q9C0D0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHACTR1Q9C0D0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PHACTR1Q9C0D0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms