Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM9Q9C026 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM9Q9C026 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM9Q9C026 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms