Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GSDMCQ9BYG8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GSDMCQ9BYG8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSDMCQ9BYG8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms