Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NUP85Q9BW27 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP85Q9BW27 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP85Q9BW27 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms