Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MESP1Q9BRJ9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MESP1Q9BRJ9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MESP1Q9BRJ9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms