Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLF1Q9BQI6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLF1Q9BQI6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLF1Q9BQI6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms