Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPAS2Q99743 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NPAS2Q99743 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPAS2Q99743 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms