Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC85AQ96PX6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC85AQ96PX6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC85AQ96PX6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC85AQ96PX6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 271.8 ms