Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBE2E2Q96LR5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE2E2Q96LR5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms