Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
BCANQ96GW7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
BCANQ96GW7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
BCANQ96GW7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
BCANQ96GW7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
BCANQ96GW7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
BCANQ96GW7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BCANQ96GW7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
BCANQ96GW7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
BCANQ96GW7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
BCANQ96GW7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
BCANQ96GW7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
BCANQ96GW7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
BCANQ96GW7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
BCANQ96GW7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
BCANQ96GW7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
BCANQ96GW7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
BCANQ96GW7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
BCANQ96GW7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
BCANQ96GW7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
BCANQ96GW7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
BCANQ96GW7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
BCANQ96GW7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
BCANQ96GW7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
BCANQ96GW7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
BCANQ96GW7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
BCANQ96GW7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
BCANQ96GW7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
BCANQ96GW7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms