Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SGF29Q96ES7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGF29Q96ES7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SGF29Q96ES7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms